Sayıştay'ın Marmara ve Düzce depremleri sonrasında hazırladığı raporda, Bayındırlık Bakanlığı'na ağır suçlamalar yöneltildi. TBMM'ye sunulan raporda depremlerin ardından hak sahiplerine sunulan konut seçeneklerinde adaletsiz davranıldığı dile getirilirken düzenlemelerin gecikmesi yüzünden konutların yapımının geciktiği ve maliyetlerin arttığı belirtildi. Bayındırlık Bakanlığı'nın faaliyetlerini saydamlık ilkelerine aykırı olarak niteleyen rapor kalıcı konut yapımında Bakanlık ve Başbakanlığın görev alması sonucu farklı tip, büyüklük ve maliyette konutlar yapılarak hak sahiplerine eşit olmayan seçenekler sunulduğu görüşüne yer veriyor.
Raporda ayrıca hasar tespit sonuçlarına yapılan itirazların büyük bölümünün haklı çıktığı, bunun da ilk hasar tespitlerinin sağlıklı yapılmadığını gösterdiği; deprem sonrası görevlendirilen çok sayıda kurum arasında işbirliği sağlanamadığı için, faaliyetlerin olumsuz etkilendiği; ihalede indirimler sonucu ortalama konut maliyetinin altyapı hariç 9.6 milyar lira olduğu, ancak sözleşmesine göre anahtar teslimi ihale edilen kalıcı konutlara fiyat farkı ödenmesinin, ortalama maliyeti yaklaşık 21.1 milyar lira çıkardığı belirtiliyor.